高浓度的次氯酸钠溶液不仅会影响根尖周疾病的愈合，还容易损伤口腔黏膜，故而考虑到毒性方面的因素，临床多是选择次氯酸钠液作为根管冲洗药物，使其溶解根管内有机物与灭菌能力都会大大的减轻。因此，次氯酸钠液作为根管冲洗药物单独应用在临床，冲洗效果并不太理想。次氯酸钠液性质不够稳定，储存时间过久或是放置不当容易发生变性，影响冲洗的效果。低浓度的次氯酸钠溶液有刺激性气味，操作不当会引起患者恶心、呕吐。次氯酸钠作为氧化剂时，在活性炭催化作用下可直接将十二碳硫醇恶臭物质氧化而成为无臭、无味、透明的磺酸水溶液存在。这里应指出的是，如不加入活性炭作为催化剂应用，次氯酸钠不能将十二碳硫醇完全氧化成为无臭的物质，也就是磺酸。